| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004615 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Legionella septentrionalis strain km711, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Legionella septentrionalis |
| アクセッション番号またはID | RZGS00000000 |
| コメント | Legionella septentrionalis strain km711, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | RZGS00000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2019-01-01 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 85 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | km711 |
| 分離源 | river water |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | The Legionella septentrionalis whole genome shotgun (WGS) project has the project accession RZGS00000000. This version of the project (01) has the accession number RZGS01000000, and consists of sequences RZGS01000001-RZGS01000085.; Annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (released 2013). Information about the Pipeline can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 06-DEC-2018 ; Assembly Method :: SPAdes v. v3.12.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 370x ; Sequencing Technology :: Illumina NextSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 12/26/2018 23:29:02 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 4.7 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 2,460 ; CDSs (total) :: 2,410 ; Genes (coding) :: 2,338 ; CDSs (with protein) :: 2,338 ; Genes (RNA) :: 50 ; rRNAs :: 3, 2, 3 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2 (5S) ; partial rRNAs :: 1, 2, 3 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 39 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 72 ; CDSs (without protein) :: 72 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 72 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 45 of 72 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 34 of 72 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 8 of 72 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 14 of 72 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Legionella sp,whole genome shotgun sequence |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Wu,H. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (25-DEC-2018) Science & Research, kingMed Center for Clinical Laborary, No. 10 Luoxuan 3rd Road, Guangzhou International Biotech Island, Guangzhou, Guangdong 510005, China |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Wu,H. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
2.微生物種情報
5.文献情報
Not found
7.コレクション情報
8.提供機関情報
9.実験情報
Not found
10.プロジェクト情報
Not found
