解析情報 ゲノム

データID ANGE0000900000041
データタイトル ゲノム(Pseudomonas putida, whole genome shotgun sequencing project)
生物種名 Pseudomonas putida
アクセッション番号またはID GCA_029749435.1
コメント The annotation was added by the assembly submitters using the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about stand-alone PGAP can be found here: https://github.com/ncbi/pgap/This draft WGS assembly was generated by running SKESA to generate a de-novo assembly. The de-novo assembly was then concatenated with contigs generated using a guided assembler using antimicrobial resistance genes as baits to comprehensively catalog the set of resistance genes in the isolate. Note, some parts of the contigs derived from the guided assembler may overlap de-novo contigs, and other guided assembler contigs. De-novo contigs can be differentiated from guided assembler contigs by their names , which include either 'denovo' or 'guided'.
ゲノム配列のバージョン GCA_029749435.1
登録日または更新日 2023-04-14
配列取得用URL
配列ファイルダウンロード
配列長(bp)または配列数(rc) 5580655
形態
BioProject
BioSample
配列の種類
strain NBRC 109347
分離源
plasmid
備考
菌株へのコメント
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  タイトル
  雑誌名/登録機関名
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提供機関 1 Taxonomy プロジェクト 0 コレクション 1 微生物種 1 実験 0 微生物株 1 属性 文献 0 解析データ

1.微生物株情報  1件

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