データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名(著者名含) | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株(変異株の場合) | 付加情報 |
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データID | ANGE0000900000041 |
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データタイトル | ゲノム(Pseudomonas putida, whole genome shotgun sequencing project) |
生物種名 | Pseudomonas putida |
アクセッション番号またはID | GCA_029749435.1 |
コメント | The annotation was added by the assembly submitters using the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about stand-alone PGAP can be found here: https://github.com/ncbi/pgap/This draft WGS assembly was generated by running SKESA to generate a de-novo assembly. The de-novo assembly was then concatenated with contigs generated using a guided assembler using antimicrobial resistance genes as baits to comprehensively catalog the set of resistance genes in the isolate. Note, some parts of the contigs derived from the guided assembler may overlap de-novo contigs, and other guided assembler contigs. De-novo contigs can be differentiated from guided assembler contigs by their names , which include either 'denovo' or 'guided'. |
ゲノム配列のバージョン | GCA_029749435.1 |
登録日または更新日 | 2023-04-14 |
配列取得用URL | |
配列ファイルダウンロード | |
配列長(bp)または配列数(rc) | 5580655 |
形態 | |
BioProject | |
BioSample | |
配列の種類 | |
strain | NBRC 109347 |
分離源 | |
plasmid | |
備考 | |
菌株へのコメント | |
参照 | |
タイトル | |
雑誌名/登録機関名 | |
出版年月 | |
巻・号・ページ | |
著者 | |
PubMed | |
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