データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名(著者名含) | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株(変異株の場合) | 付加情報 |
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データID | ANGE0000900000153 |
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データタイトル | ゲノム(Sphingopyxis sp. 113P3, complete genome) |
生物種名 | Sphingopyxis sp. 113P3 |
アクセッション番号またはID | GCF_001278035.1 |
コメント | The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/Whole genome shotgun sequencing was performed at NITE. Finishing was conducted at Tohoku University with the aid of GenoFinisher, AceFileViewer, and ShortReadManager software (http://www.ige.tohoku.ac.jp/joho/gf_e/index.php). Autoannotation was conducted using PGAP and MiGAP, and PGAP annotation was curated by referencing to the MiGAP annotation with the aid of annotation support tool of GenomeMatcher software. Strain 113P3 is available from NBRC culture collection (http://www.nbrc.nite.go.jp/e/).Annotation modified by submitter |
ゲノム配列のバージョン | GCF_001278035.1 |
登録日または更新日 | 2015-09-02 |
配列取得用URL | |
配列ファイルダウンロード | |
配列長(bp)または配列数(rc) | 4664213 |
形態 | |
BioProject | |
BioSample | |
配列の種類 | |
strain | 113P3 |
分離源 | activated sludge |
plasmid | |
備考 | |
菌株へのコメント | |
参照 | |
タイトル | |
雑誌名/登録機関名 | |
出版年月 | |
巻・号・ページ | |
著者 | |
PubMed | |
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