| データタイトル | URL | データID | 実施機関名 | 概要 | 実施日 |
|---|
実験情報
| データID | EXPE0000100140001 |
|---|---|
| データタイトル | 実験（質量分析装置によるプロテオーム解析_E. coli MGF-01_対数増殖期：Mass spectrometry proteome analysis_logarithmic phase） |
| 実施機関名 | 独立行政法人 製品評価技術基盤機構 |
| 実験に関するURL | |
| 【サンプル調製プロトコル】 | |
| 概要 | 大腸菌染色体縮小化株Escherichia coli MGF-01をM9-glucose培地で培養し、対数増殖期菌体を超音波破砕後抽出液に溶解したものをサンプルとした。 |
| 培養温度 | |
| 酸素要求性 | |
| 培養時間 | |
| 【測定プロトコル】 | |
| 測定方法 |
質量分析を用いた次の各手法により、プロテオーム解析を実施した。
（１）ショットガンプロテオーム解析法：SDS-PAGEで分離後トリプシンでゲル内消化し、LC/MS/MSで測定 （２）ペプチドマスフィンガープリント法：二次元電気泳動で分離後トリプシンでゲル内消化し、MALDI-TOFMSまたはLC/MS/MSで測定 [English] The proteome analysis by using the following methods. (1) One-dimensional SDS-PAGE in combination with two-dimensional LC-MS/MS (2) Two-dimensional PAGE followed by MALDI-TOFMS |
| 測定ツール | イオントラップ型質量分析装置 LTQ (Thermo) |
| MALDI-TOF質量分析装置 Ultraflex (Bruker) | |
| 【データ解析プロトコル】 | |
| 解析方法 | Mascot (Matrix Science)にて解析を行った。 |
| 解析ツール | Mascot (Matrix Science) |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
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2.微生物種情報
Not found
6.解析データ情報
6-1.ゲノム
Not found
6-2.画像
Not found
6-3.その他データ
6-4.MALDI
Not found
10.プロジェクト情報
