| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
実験情報
| データID | EXPE0000302010001 |
|---|---|
| データタイトル | 実験（カロテノイド関連遺伝子推定（Sequence）） |
| 実施機関名 | 独立行政法人 製品評価技術基盤機構 |
| 実験に関するURL | |
| 【サンプル調製プロトコル】 | |
| 概要 |
一定温度で１週間培養後、集菌（50mg以上）
○ゲノム抽出 ・Genomic DNA Buffer Set(Qiagen） ・Lysozyme(wako） ・Proteinase K（Qiagen） ○ゲノム抽出 ・EYELA DRY THERMO BATH MG-1000(TOKYO RIKAKIKAI） ・Fast Prep(MP） |
| 培養温度 | サンプルごとに設定：17, 24, 25, 28 ℃ |
| 酸素要求性 | |
| 培養時間 | 168時間 |
| 【測定プロトコル】 | |
| 測定方法 |
○濃度測定
・Quant-iT(TM)PicoGreen(TM)dsDNA Assay Kit(ThermoFisher SCIENTIFIC） ○DNA断片化 ・High Sensitivity DNA Assay(Agilent） ○MiSeqライブラリー ・TruSeq Nano DNA Low Throughput Library Prep Kit（24 samples）(Illumina） ・High Sensitivity DNA Assay(Agilent） ○MiSeqシーケンス ・MiSeq Reagent Kit v3(600 Cycles)(Illumina） |
| 測定ツール | 濃度測定: ARVO X3(PerkinElmer）, NanoDrop ND-1000(Thermo Scientific）, Mupid(ADVANCE） |
| DNA断片化: Covaris S220(Covaris), Agilent 2100 BioAnalyzer(Agilent） | |
| MiSeqライブラリー:Agilent 2100 BioAnalyzer(Agilent）, Biometra TProfessional(Biometra） | |
| MiSeqシーケンス: MiSeq system(Illumina） | |
| 【データ解析プロトコル】 | |
| 解析方法 | |
| 解析ツール | |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
2.微生物種情報
6.解析データ情報
6-1.ゲノム
6-2.画像
Not found
6-3.その他データ
Not found
6-4.MALDI
Not found
10.プロジェクト情報
