実験情報

データID EXPE0000400000006
データタイトル 実験(日本沿岸に浸漬した生分解性プラスチックに付着した微生物の分離)
実施機関名 独立行政法人 製品評価技術基盤機構
実験に関するURL
【サンプル調製プロトコル】
  概要 日本沿岸に一定期間(10~60日間程度)浸漬した生分解性プラスチックに付着した微生物を、NBRC培地No. 340, No.868, No.1510やエマルション化したプラスチックを混合した人工海水培地に播種し、生育してきたコロニーを適宜釣菌し、株化した。
  培養温度 25℃
  酸素要求性 好気性
  培養時間
【測定プロトコル】
  測定方法 株化した微生物のゲノムシーケンスをMiSeqにより行った。
  測定ツール MiSeq(イルミナ)
【データ解析プロトコル】
  解析方法 アセンブルを行い、DFASTを利用してアノテーションを実施した。
  解析ツール Unicycler 0.5
関連情報

このデータにリンクしている情報

提供機関 Taxonomy プロジェクト 1 コレクション 微生物種 21 実験 微生物株 22 属性 文献 解析データ 22

1.微生物株情報  22件

2.微生物種情報  21件

6.解析データ情報

6-1.ゲノム  22件

6-2.画像  0件

Not found

6-3.その他データ  0件

Not found

6-4.MALDI  0件

Not found

10.プロジェクト情報  1件

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