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微生物 : Thermus thermophilus

微生物株情報

NBRC番号 101084
学名 Thermus thermophilus
別名(シノニム) 該当データなし
由来 Tokyo Univ. Pharmacy Life Science (T. Oshima & A. Yamagishi, HB8)
他保存機関番号 ATCC 27634=DSM 579=JCM 10941=NCIMB 11244
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseTTHA0062
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須A
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseTTHA1179
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseTTHA1843
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ITTHA1844
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseTTHA1496
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseTTHA0172
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseTTHA1153
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinTTHA0579 TTHA0975
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTTHB082 TTHA0259 TTHA1628 TTHA0717 TTHA0379
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTTHB082 TTHA1628 TTHA0717 TTHA0379 TTHA0259
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinTTHA0716
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須B
PHEA1
(NRULE_0083)
Aromatic ring hydroxylaseTTHA0960 TTHB249
任意 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinTTHB128 TTHA1400 TTHA1841 TTHA1931
 
FADR1
(NRULE_0101)
NADH-dependent flavin reductaseTTHA0961 TTHA0420 TTHA1858 TTHB095 TTHB244
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseTTHA1062
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2TTHA1062
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDTTHA1064
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseTTHA0336
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseTTHA1063
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFTTHA0527
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須C
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseTTHA1179
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseTTHA0478
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSTTHA0704
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTTTHA0707

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA13202
ローカスタグTTH
INSDC entriesAP008226
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数3
サイズ(bp) 2,116,056
遺伝子数 2,238
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
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604.4 KB 574.3 KB 413.3 KB 193.2 KB