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微生物 : Chryseobacterium gleum

微生物株情報

NBRC番号 15054
学名 Chryseobacterium gleum
別名(シノニム) Flavobacterium gleum
由来 IFO 15054 <- ATCC 35910 <- R.J. Owen
他保存機関番号 ATCC 35910=CCUG 14555=CIP 103039=JCM 2410=LMG 8334=NCTC 11432
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF0204_10265
Alginate degradation(NFUNC_0062)
必須B
ALY
(NRULE_0227)
Alginate lyaseHMPREF0204_13464
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseHMPREF0204_13370 HMPREF0204_11428
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF0204_14621
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須D
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DHMPREF0204_10459
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseHMPREF0204_13820
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseHMPREF0204_12980
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0204_13743 HMPREF0204_13228
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0204_13228 HMPREF0204_13743
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinHMPREF0204_13229
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseHMPREF0204_12049
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseHMPREF0204_11068
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseHMPREF0204_14278
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseHMPREF0204_11466
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須B
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DHMPREF0204_10459
Phytic acid hydrolysis(NFUNC_0085)
必須A
PHYT
(NRULE_0258)
3-phytaseHMPREF0204_14259

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA30953
ローカスタグHMPREF0204
INSDC entriesACKQ02000000
ステータスWGS
解析状況Improved High-Quality Draft
コンティグ数7
サイズ(bp) 5,569,640
遺伝子数 5,289
フィニッシングゴールImproved High-Quality Draft
アセンブル方法Newbler Assembler v. 2.3.10192009
冗長度31.57x
シーケンス方法
  • 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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1.6 MB 1.6 MB 1.0 MB 447.8 KB