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微生物 : Renibacterium salmoninarum

微生物株情報

NBRC番号 15589
学名 Renibacterium salmoninarum
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 15589 <- ATCC 33209 <- J.L. Fryer, Lea-1-74
他保存機関番号 ATCC 33209=CIP 103036=DSM 20767=JCM 11484=LMG 10846=NCMB 2235
他株番号 Lea-1-74
参考文献
16348993
Nutrient Requirements of Renibacterium salmoninarum on Agar and in Broth Media. (Appl Environ Microbiol. 1993)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseRSal33209_1700 RSal33209_0874
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須A
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseRSal33209_0650
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseRSal33209_2894
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IRSal33209_2337
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseRSal33209_2045
GABA biosynthesis(NFUNC_0066)
必須A
GAD
(NRULE_0231)
Glutamate decarboxylaseRSal33209_2078
O-Glycan degradation(NFUNC_0084)
必須A
ENGBF
(NRULE_0257)
Endo-alpha-N-acetylgalactosaminidaseRSal33209_1327 RSal33209_1328
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseRSal33209_2019
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinRSal33209_0444
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinRSal33209_0679 RSal33209_3410
F
SOXR
(NRULE_0329)
Redox-sensitive transcriptional activator SoxRRSal33209_3062
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinRSal33209_0679 RSal33209_3410
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinRSal33209_0680
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須C
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseRSal33209_0650
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseRSal33209_0446
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseRSal33209_0445
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSRSal33209_2009
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTRSal33209_2003

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA19227
ローカスタグRSAL33209
INSDC entriesCP000910
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 3,155,250
遺伝子数 3,507
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
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960.8 KB 881.6 KB 597.9 KB 280.2 KB