Aspergillus oryzae RIB40 (NBRC 100959)
プロテオーム解析の概要
麹菌Aspergillus oryzae RIB40 (NBRC 100959)のYPD培地による液体培養とフィルター培養を行い、下記の各手法によって網羅的プロテオーム解析を実施しました。
- （１）ペプチドマスフィンガープリント法（二次元電気泳動、MALDI-TOFMS ）
- （２）ショットガンプロテオーム解析法（SDS-PAGE、LC/MS/MS）
- （３）多次元LC法（二次元LC、カラム内消化、LC/MS/MS）
また、プロテインシーケンサーによるN末端アミノ酸解析も行いました。
解析結果
新たなCDSの付加や、登録CDSの修正が必要であると分かりました。現在コンソーシアムでの修正公開の準備がなされています。
公開中のプロテオーム解析結果は現データに合致するもののみとなっています。
解析結果は、生物資源データプラットフォーム（DBRP）で公開されています。
発表等
- Hanako Ataku, Miyako Mise, Keiko Nishijima, Jun Yamazaki, Kazumi Sasaki, Syuji Yamazaki, Motoaki Sano and Nobuyuki Fujita
- “Proteome Analysis of Aspergillus oryzae for Precise Prediction of Protein Coding Regions and Protein Profiling”, 55th ASMS Conference (2007)
お問い合わせ
- 独立行政法人製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター 解析技術課
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