NBRC皮膚常在微生物カクテル
皮膚マイクロバイオームは皮膚の健康の維持、アトピー性皮膚炎や乾癬（皮膚の炎症とともに角質層が厚く硬くなる病気）などの皮膚疾患に密接に関与していることが明らかにされています※1,2。また、ヒトの皮膚と住環境中の微生物群集には関連性があることから※3、皮膚マイクロバイオームを住環境の改善や法医学的な個人識別※4に活用するなどの産業応用が強く期待されています。
しかしながら、皮膚マイクロバイオームは腸内などに比べて菌量がとても少なく、真菌（カビや酵母）の存在割合が高いため、サンプリング方法や処理方法の違いにより、マイクロバイオーム解析結果にばらつきが生じやすいことが課題でした。ラボ間や作業者の違いによる解析データのばらつきをなくし、再現性を確保するには、解析手法の妥当性評価や、試験あるいはラボ間の実験精度管理を行うことが必要です。
NBRCは、皮膚マイクロバイオーム研究をサポートするために、一般社団法人日本マイクロバイオームコンソーシアム（JMBC）と国立研究開発法人産業技術総合研究所（産総研）モレキュラーバイオシステム研究部門と共同で「NBRC皮膚常在微生物カクテル」を開発し、2025年6月2日より提供を開始しました。
※1：Boxberger M. et al., Microbiome, 30;9(1):125 (2021)
※2：中島沙恵子, 日本香粧品学会誌, 46(2):137–140 (2022)
※3：Lax S. et al., Science, 345:1048-1052 (2014)
※4：Fierer N. et al., PNAS, 107:6477-6481 (2010)
NBRC皮膚常在微生物カクテルのラインナップ
現在、提供しているNBRC皮膚常在微生物カクテルは以下の2種類です。
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製品名
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NBRC皮膚常在菌菌体カクテル
Cell-Mock-004 |
NBRC皮膚常在菌DNAカクテル
DNA-Mock-004 |
| 内容量 | 500 µL × 1本 | 30 µL × 1本 |
| 手数料 （税込・送料別） |
¥19,140 | ¥51,150 |
| 保存溶媒 | 15% glycerol in PBS（pH7.4） | 10 mM Tris-HCl（pH8.5） |
| 含有量 | 5x108 細胞/500 µL | 1500 ng/30 µL |
| 保存形態 | 凍結（－80℃）※5 | 凍結（－80℃）※5 |
| データシート | 241001SC 提供中のロット |
250201SD 提供中のロット |
- ※5：入手後は－80℃のフリーザーで、凍結保存を行ってください。
- ・手数料は送料を含みません（送料着払いにて送付します）。
- ・振込手数料は依頼者様がご負担ください。
NBRC皮膚常在微生物カクテルの特徴と含まれる微生物
本カクテルは、NBRCで取得した皮膚マイクロバイオームデータとOhら※6や柴垣ら※7の報告を参考に選定した、細菌14株と真菌4株から構成されています。
※6：Oh J. et al., Nature. 514:59–64 (2014)
※7：Shibagaki N. et al., Scientific Reports. 7:10567 (2017)
NBRC皮膚常在微生物カクテルに含まれる14種類の細菌
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学名
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NBRC
番号 |
グラム染色
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ゲノム
サイズ（Mbp） |
GC含量(%)
|
16S
rRNA コピー数 |
バイオ
セーフティ レベル |
|
Anaerococcus nagyae
|
陽性 | 1.9 | 30.7 | ４ | １* | |
| Corynebacterium pseudogenitalium | 113660 | 陽性 | 2.5 | 59.5 | 4 | 1 |
| Corynebacterium striatum | 15291T | 陽性 | 3.1 | 59.1 | ４ | 1* |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes | 113869 | 陽性 | 2.6 | 60.0 | 3 | 1* |
| Finegoldia magna | 113804 | 陽性 | 1.7 | 32.1 | 4 | 1* |
| Staphylococcus capitis | 115779 | 陽性 | 2.5 | 32.8 | 6 | 1* |
| Staphylococcus epidermidis | 113846 | 陽性 | 2.5 | 32.1 | 6 | 1* |
| Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus | 113928 | 陽性 | 2.3 | 31.8 | 6 | 1* |
| Streptococcus salivarius | 13956 | 陽性 | 2.1 | 39.9 | 6 | 1* |
| Acinetobacter radioresistens | 102413T | 陰性 | 3.4 | 41.4 | 6 | 1* |
| Escherichia coli | 3301 | 陰性 | 4.8 | 50.8 | 7 | 1 |
| Moraxella osloensis | 115781 | 陰性 | 2.9 | 43.3 | 4 | 1* |
| Pseudomonas putida | 14164T | 陰性 | 6.2 | 62.3 | 7 | 1* |
| Roseomonas mucosa | 115778 | 陰性 | 4.9 | 70.5 | 5 | 1* |
NBRC皮膚常在微生物カクテルに含まれる4種類の真菌
NBRC皮膚常在菌菌体カクテル (Cell-Mock-004)
NBRC皮膚常在菌菌体カクテルは、ヒトの皮膚などに生息する18種類のNBRC株を純粋培養し、それぞれの細胞または胞子数が細菌：真菌＝10：1になるように混合したものです。
DNA抽出効率が異なるグラム陽性/陰性菌に加え、真菌の細胞あるいは胞子を混合しているため、DNA抽出における試薬の検討や一連の実験工程を通したプロトコルの検証などにおすすめです。
- ※8：データシートでは各ロットにおけるデジタルPCRを用いた混合割合等の検証結果を公開しています。
NBRC皮膚常在菌DNAカクテル (DNA-Mock-004)
NBRC皮膚常在菌DNAカクテルは、ヒトの皮膚などに生息する18種類のNBRC株の純粋培養物からゲノムDNAを抽出し、それぞれのゲノムDNAのコピー数が細菌：真菌＝10：1になるよう混合したものです。
サイズやGC含量、分類群が異なるゲノムを混合しているため、シーケンスライブラリーの調製方法やデータ解析方法の検証などにおすすめです。
- データシート※8 250201SD
- ※8：データシートでは各ロットにおけるデジタルPCRを用いた混合割合等の検証結果を公開しています。
NBRC皮膚常在微生物カクテル構成株のゲノム配列情報
| 学名 | NBRC 番号 |
ゲノム情報 アクセッション番号 |
分離源
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| Anaerococcus nagyae | 113824 | AP031484 | ヒトの皮膚（腋の下） |
| Corynebacterium pseudogenitalium | 113660 | AP031485 | ヒトの皮膚 |
| Corynebacterium striatum | 15291T | BJLD00000000 | 不明 |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes | 113869 | CP084017 | ヒトの皮膚（鼻） |
| Finegoldia magna | 113804 | AP031486 | ヒトの糞便 |
| Staphylococcus capitis subsp. capitis | 115779 | AP031467- AP031471 | ヒトの皮膚（顎） |
| Staphylococcus epidermidis | 113846 | CP084008-CP084011 | ヒトの皮膚（鼻） |
| Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus | 113928 | AP031487 | ヒトの皮膚（肘） |
| Streptococcus salivarius | 13956 | AP031488 | 不明 |
| Acinetobacter radioresistens | 102413T | AP019740-AP019748 | γ線滅菌された綿 |
| Escherichia coli | 3301 | CP048439, CP048440 | ヒトの糞便 |
| Moraxella osloensis | 115781 | AP031472- AP031483 | ヒトの皮膚（肘窩） |
| Pseudomonas putida | 14164T | AP013070 | 不明 |
| Roseomonas mucosa | 115778 | AP031462- AP031466 | ヒトの皮膚（胸） |
| Aspergillus brunneoviolaceus | 4062 | 登録準備中 | ヒトの皮膚（腕） |
| Candida tropicalis | 1404 | 登録準備中 | ヒトの皮膚（感染した手） |
| Trichophyton rubrum | 9185 | 登録準備中 | 不明 |
| Malassezia globosa | 101597 | 登録準備中 | ヒトの皮膚 |
NBRC皮膚常在微生物カクテルの品質確認
製造したNBRC皮膚常在微生物カクテルの品質確認は、JMBCから公開されている皮膚マイクロバイオームの推奨プロトコル※9に準じたDNA抽出方法と、独自のデジタルPCRの検出系により実施し、一定の品質基準を満たすものであることを確認しています。
※9：https://jmbc.life/sop/index.html
アプリケーション例
NBRC皮膚常在微生物カクテルは、試料からのDNA 抽出方法、アンプリコンシーケンス解析に用いるプライマーの選定やライブラリー調製試薬等の評価をはじめとしたプロトコルの確認、作業者間の手技の確認や新規作業者のトレーニングなどにお使い頂けます。
【利用例】
●菌叢解析におけるコントロール
●試薬・キットの開発における疑似サンプル
●事業所・作業者ごとの精度管理用サンプル
●プロトコル（方法・試薬）の確認
●SOP（標準作業手順書）のバリデーション
●試薬・装置の開発
●模擬微生物叢
●作業者の教育訓練
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お問い合わせ
- 独立行政法人製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター バイオ技術評価・開発課（かずさ）
-
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