バイオテクノロジー

アナエロリネア属細菌(Anaerolinea thermophila UNI-1T(= NBRC 100420T))

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Chloroflexi 門には様々な表現型を示すバクテリアが含まれ、生息環境も多岐にわたります。現在、Chloroflexi 門は16S rRNA遺伝子の配列によって最低でも5つの綱に分けられます。Anaerolinea thermophila UNI-1T(= NBRC 100420T)は、あらゆる環境中からその存在が示唆されながら長年分離株が出現してこなかったAnaerolinea綱に属する、Anaerolinea綱初の分離培養株です。

A. thermophila UNI-1T は、油揚げ工場の高温廃水処理リアクター中のメタン発酵汚泥から分離された偏性嫌気性の糸状細菌(径0.2-0.3㎛, 長さ100㎛以上)で、酵母エキス存在下で多くの炭水化物やアミノ酸を化学有機栄養的に利用して生育します。

ゲノム解析の結果、A. thermophila UNI-1T は1本の環状染色体(3,532,378 bp; G+C含量 53.8%)を持ち、その染色体上には 3,179 個の遺伝子が予測されました。これらのゲノム配列から予測された遺伝子を解析し、代謝系の再構築を行った結果、核酸やメチオニン、脂肪酸、ビタミン、補酵素などの生育に必須である物質の生合成経路の多くが不完全であることが判明しました。特に脂肪酸の生合成経路では、脂肪酸の炭素鎖伸長に関与する遺伝子群が既知の遺伝子との相同性からは存在しませんでした。一方でA. thermophila UNI-1Tのゲノムには、主にarchaeaを中心に見つかってきたユニークな遺伝子や代謝経路が存在することも明らかになりました。

本菌のゲノム解析結果を基にAnaerolineae 綱に属する微生物種の研究がさらに発展し、本菌を取り巻く生態環境の解明にもつながることが期待されます。


Anaerolinea thermophila UNI-1T 電子顕微鏡写真
産業技術総合研究所・関口氏 提供

ゲノムサイズ(bps) 3,532,378
ORF 3,177
GC含量(%) 53.85
データベース DOGAN
NBRC番号 100420
代表共同研究先 独立行政法人産業技術総合研究所

References:

[1] Syntrophothermus lipocalidus gen. nov., sp. nov., a novel thermophilic, syntrophic, fatty-acid-oxidizing anaerobe which utilizes isobutyrate.
Sekiguchi, Y., Kamagata, Y., Nakamura, K., Ohashi, A., Harada, H. (2000)
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50:771-779. [PMID:10758888]
[2] In situ detection, isolation, and physiological properties of a thin filamentous microorganism abundant in methanogenic granular sludges: a novel isolate affiliated with a clone cluster, the green non-sulfur bacteria, subdivision I.
Sekiguchi, Y., Takahashi, H., Kamagata, Y., Ohashi, A., Harada, H. (2001)
Appl. Environ. Microbiol. 67:5740-5749 [PMID:11722931]
[3] Anaerolinea thermophila gen. nov., sp. nov. and Caldilinea aerophila gen. nov., sp. nov., novel filamentous thermophiles that represent a previously uncultured lineage of the domain Bacteria at the subphylum level.
Sekiguchi, Y., Yamada, T., Hanada, S., Ohashi, A., Harada, H., Kamagata, Y. (2003)
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 53:1843-1851 [PMID:14657113]
[4] Characterization of filamentous bacteria, belonging to candidate phylum KSB3, that are associated with bulking in methanogenic granular sludges.
Yamada T, Yamauchi T, Shiraishi K, Hugenholtz P, Ohashi A, Harada H, Kamagata Y, Nakamura K, Sekiguchi Y.(2007)
ISME J. 3:246-255 [PMID:18043635]

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