バイオテクノロジー

微生物遺伝子機能検索データベース (MiFuP)の公開

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NITEでは、生物資源とその関連情報(生物の特定情報、オミックス情報など)が利用可能な生物資源データプラットフォーム(Data and Biological Resource Platform = DBRP)を公開しました。
 NBRCが保有する2万種類以上の微生物に関連した情報を搭載しており、今後も情報を追加していく予定です。

データベース構築の背景

これまで微生物の有用機能を推定するには、ゲノム配列の膨大なデータの中から、遺伝子(遺伝情報がコードされた、 ゲノム配列の特定の領域)を特定し、さらにその機能に係わる学術論文等から遺伝子の組み合わせ(遺伝子セット)に関係する記述を理解した上で、 微生物の機能の有無を判断しなければならず、ゲノムや遺伝子解析に関する専門知識を必要とする非常に煩雑で時間のかかるものでした。

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MiFuPの概要

  1.  ・NBRCが保有する生物資源に対して蓄積された豊富なデータに加えて、物質生産や薬剤耐性などの特性情報や文献情報、およびゲノムなどのオミックス情報といった様々な情報を関連するデータベースから集収し生物資源にひもづけて、一元化しています。これにより、生物資源に関する様々な情報をまとめて検索することができ、効率的な情報収集が可能です。
  2.  ・登録データの日本語化を推進しており、「乳酸菌」などの一般的なキーワードで検索できます。採取地(国名、地名)、分離源(食品由来など)からの検索や、データの種類(ゲノム情報、画像情報など)を選択しての検索もできます。
  3.  ・様々な機関の生物資源とその情報の登録機能を有しています。企業、大学、公的機関などからの生物資源情報の登録を受け付けております。
  4.  ・詳細については、、[DBRP] DBRPとはをご覧ください。

ご利用は以下のバナーからお入りください。

微生物遺伝子機能検索データベースMiFuP

 

最終更新日

2019年6月26日

 

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MiFuP画面イメージ (画像をクリックすれば拡大できます)

MiFuP 検索トップ画面の図が拡大します

MiFuP 微生物 機能検索結果の図が拡大します

MiFuP 機能検索結果の図が拡大します

MiFuP 機能検索画面の図が拡大します

お問い合わせ

独立行政法人製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター  計画課 バイオIT戦略室
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