プロテオーム解析とは？

プロテオーム解析とは

「プロテオーム（proteome）」とはprotein（タンパク質）とgenome（ゲノム）を組み合わせた造語であり、ゲノムが一個の生物の持つ全ての遺伝情報を指すのに対し、プロテオームは、細胞内で発現している（発現する可能性をもつ）全タンパク質のことを指します。

生体内では、多数の遺伝子から作られる多様な種類のタンパク質が働いて生命活動を支えていますが、それらのタンパク質の構造や機能は、これまでは膨大な時間と労力を費やして個別に単離して解析するしかありませんでした。しかし近年になって、微量のタンパク質断片の質量を正確に測定することができるようになりましたので、種々の電気泳動やクロマトグラフィーを組み合わせて分離された少量のタンパク質を断片化してその質量を測定し、得られたデータをゲノム解析から推定されるタンパク質のアミノ酸配列データと比較して同定することが可能になりました。このようにして、生物のもつタンパク質の構造や機能を網羅的に解析することをプロテオーム解析といいます。

ゲノム解析で得られる情報は、特定のタンパク質を作る可能性をもった遺伝子があるという情報ですから、プロテオーム解析によって実際に細胞内で働いているタンパク質についての情報を付加することにより、生物のゲノム情報は産業に利用しやすくなります。

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プロテオーム解析の流れ（ペプチドマスフィンガープリント法）

NITEが塩基配列決定を実施した微生物（Aeropyrum pernix K1^T (= NBRC 100138^T)など）について、プロテオーム解析を行っています。プロテオーム解析は、
（１）タンパク質の発現、（２）タンパク質の分離、（３）タンパク質の同定、（４）ゲノムデータベースへの反映、という手順を経て行われます。