バイオテクノロジー

NBRCニュース 第99号

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NBRCニュース 第99号
2026/06/01
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  1.  
  新たにご利用可能となった微生物株
微生物イメージ画像
◆NBRC株
   糸状菌11株、細菌55株、アーキア1株、微細藻類4株が新たにご利用可能となりました。
   糸状菌では、日本で初めてイチジクの果実から分離されたGilbertella persicaria NBRC 117455をそのゲノム情報とともに公開しました。Gilbertella persicariaは、イチゴやモモ、ナシなどの果実の腐敗を引き起こすことで知られています。

   細菌では、油汚染土壌から分離されたNovosphingobium olei NBRC 114364及びNBRC 114365、クロフネツツジの花から分離されたSpirosoma rhododendri NBRC 114513などを公開しました。

   微細藻類では、野外のステンレス製手すりの表面から分離されたHeterochlorella sp. NBRC 113314とNBRC113316、サッシのゴムパッキンの表面から分離されたChloroidium saccharophilum NBRC 113323、風呂場の付着物から分離されたPseudochoricystis sp. NBRC 107059を公開しました。

【新たに分譲を開始した微生物資源】
https://www.nite.go.jp/nbrc/cultures/nbrc/new_strain/new_dna.html
  2.  
  DBRP新ツールリリースのお知らせ
     
  「微生物選定支援ツール」公開
   いつもDBRP(生物資源データプラットフォーム)をご利用頂き、まことに有難うございます。
   このたび、皆様の研究や実験の効率を向上させる新たなツールとして、「微生物選定支援ツール」を公開しました。ぜひご活用下さい。

◆ 微生物選定支援ツールとは
   
「特定の性質(培養温度、培養pH、酸素要求性、好塩性など)に基づいて微生物を効率よく探したい」、「論文を当たることなく微生物の培養条件をすばやく絞り込みたい」、そんなご要望にお応えするのが「微生物選定支援ツール」です。

   NBRCオンラインカタログ(1)、JCMオンラインカタログ(2)、JGI GOLD(3)、BV‑BRC(4)、TEMPURA(5)など、複数のデータベースから集めた培養温度や酸素要求性などの特性情報約67,000件を、種ごとに整理・統合し、微生物の選定・培養条件検討を支援するデータベースを構築しました。(図1)
 
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図1 微生物選定支援ツールのコンセプト

◆ 何ができるの?
  
 画面上で、「培養温度」、「培養pH」、「酸素要求性」などの特性や、「学名」、「NCBI Taxonomy ID」を条件として指定するだけで、該当する微生物種を簡単に検索・絞り込みできます。(図2)
   目的に合った微生物を迅速かつ効率的に見つけることが可能です。
 
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図2 検索画面及び検索結果画面の例

◆ どこで利用できるの?
   
「微生物選定支援ツール」はDBRPのトップページ左側メニュー(図3)からアクセスできます。
   また、下記リンクからも直接ご利用いただけます。
  
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図3 DBRPトップページ左側のMENU

◆ 詳細な使い方や特性項目について
   「より詳しい使い方や、扱っている特性項目、ご利用時の注意点については、「微生物選定支援ツールとは」のページをご覧下さい。

   今後も、皆様の研究・開発活動を支援するため、さらなるサービス向上に努めてまいります。
 
【参考】
1. NBRCオンラインカタログ
   https://www.nite.go.jp/nbrc/catalogue/
2. JCMオンラインカタログ
   https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
   https://rdfportal.github.io/website/ja/dataset/jcm/
3. JGI GOLD(Joint Genome Institute Genomes Online Database)
   https://gold.jgi.doe.gov/
   https://gold.jgi.doe.gov/downloads
4. BV-BRC(Bacterial and Viral Bioinformatics Resource Center)
   https://www.bv-brc.org/
5. TEMPURA(Database of Growth Temperatures of Usual and Rare Prokaryotes)
   https://togodb.org/db/tempura

【微生物選定支援ツール】
https://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/trait-search/

【DBRP】
https://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/top
  3.  
  MALDI-TOF MS微生物同定用ライブラリー(指紋判定法)の
     
  更新のお知らせ (Alicyclobacillus属/ Paenalicyclobacillus属)
   MALDI-TOF MSを用いた微生物同定法は、その迅速性や簡便さから、食品の微生物検査に用いられている手法です。近年では微生物探索にも利用されています。NBRCは、微生物同定を技術的に支援するため、指紋判定法での同定に用いる「MALDI-TOF MS微生物同定用ライブラリー 」を構築し公開しています。

   この度、耐熱性好酸性菌として知られるAlicyclobacillus属/ Paenalicyclobacillus属細菌のMALDI Biotyper(R)対応マススペクトル・ライブラリーに新たに17種を追加し、合計で26種、56株のライブラリーをご利用いただけるようになりました。

   Alicyclobacillus属/ Paenalicyclobacillus属は耐熱性があり、かつ酸性下で生育することから、一部の種は果実飲料や酸性飲料に混入してグアイアコールを産生し、薬品臭変敗を引き起こす危害菌として知られています。
   今回追加した17種の中には、グアイアコールを産生するAlicyclobacillus suciAlicyclobacillus herbariusも含まれています。

   また、本属は培養条件によってマススペクトルのパターンに違いが出やすい傾向があったため、複数の培養条件(BAT培地、YSG培地、異なる培養日数等)で調製したサンプルごとにマススペクトル・ライブラリーを作成しました。MALDI-TOF MS微生物同定用の参照用ライブラリーとしてぜひご利用ください。

【詳細】 https://www.nite.go.jp/nbrc/industry/maldi/maldi.html

   また、MALDI-TOF MSを用いた微生物同定法についてはこちらの記事もご覧ください。
   NBRCニュース第50号
   NBRCニュース第52号

※Sinninghe Damsté, J.S.ら(2025) によりAlicyclobacillus属の再分類が行われ、新属Paenalicyclobacillus属が提唱されました(1)。今回データを公開した種は、Alicyclobacillus属とPaenalicyclobacillus属の既知種に加え両属の新種候補のCandidatusも含まれています。

 【参考】
(1) Sinninghe Damsté et al. (2025) Syst. Appl. Microbiol. 48, 126651.
      DOI:10.1016/j.syapm.2025.126651
4.  
  真菌のMALDI-TOF MS実測データ公開のお知らせ
   NBRCは、株式会社島津製作所、国立研究開発法人産業技術総合研究所との三者共同研究で得られた微生物のMALDI-TOF MS実測データを、テキスト形式のマススペクトルデータとして無償で提供しています。
   現在公開している細菌(591種)に加え、2026年5月から新たに真菌(168種)のデータの提供を開始しました。詳細は以下URLよりご覧ください。

   MALDI-TOF MS実測データは、微生物細胞を直接または溶菌し、MALDI-TOF MSで測定して得られたタンパク質の質量(マス)スペクトルデータです。微生物が産生する主要なタンパク質の分子量を推定することができますので、 MALDI-TOF MSによる識別・同定だけではなく、有用物質産生能の探索などにもご活用いただけます。

【詳細】 https://www.nite.go.jp/nbrc/industry/maldi/maldi-data.html
  5.  
  「微生物有害情報リスト(真菌リスト)」Web版を公開しました!
   NBRCは、微生物有害情報データベース(M-RINDA)において、細菌/真菌の危険度分類や法規制情報を一元化した「微生物有害情報リスト」を公開しています。これまでExcel版で公開しておりました「真菌リスト」について、2026年4月27日に新たにWeb版を公開しました。

■主な更新内容
(1) Webから真菌リストを確認可能に
   これまで、真菌リストのご利用はExcel版をダウンロードいただく必要がございましたが、細菌リストと同様にWebからもリスト形式でご利用いただくことができるようになりました。

   Web版では、異名の関係にある微生物名の情報をまとめた表を「学名詳細ページ」(別ウィンドウ)に表示する機能があり、それぞれの学名に対して、各出典資料で指定されている法令やBSL分類等の情報をまとめて確認することができます(図1)。

   分類体系の変更により、出典資料によって記載されている学名が異なる場合があるため、リスク情報を確認する際には「学名詳細ページ」をご活用ください。
 
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図1 真菌リスト(Web版)と学名詳細ページの表示例

(2) 細菌リストと真菌リストを一括検索することが可能に
   これまで、細菌リストを対象にご利用いただけた「検索」ページに、新たに真菌リストも対象として追加し、両方を一括検索することができるようになりました。学名、キーワード、リスク情報を指定して一括検索することができ、検索結果は細菌/真菌タブに分かれて表示されます(図2、3)。
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図2 「検索」ページの検索条件指定例
 
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図3 検索結果画面

   今回のWeb版公開に合わせて、微生物有害情報リストの詳しい利用方法についてまとめたヘルプページも更新しておりますので、ご利用の際はこちらもご参照ください。

   今後も更新を続け、皆様のお役に立つ情報の提供や内容の充実に努めてまいります。ご要望やご意見などがございましたら、ぜひお寄せください。

   微生物有害情報リストは、以下のURLより無料でご利用いただけます(URLの変更はありません)。

【微生物有害情報リスト】
https://www.nite.go.jp/nbrc/mrinda/list/
※免責事項の同意画面が表示されます。
内容にご同意いただき「同意する」ボタンを押すと、リストの画面に進みます。
リスト画面の上部にある「細菌」や「真菌」などのボタンからリストを選べます。
  6.  
  NBRCが展示、発表等を行うイベントについて
ロートこどもみらい財団
   日時:2026年6月10日(水)19時00分~20時00分
   会場:会場:オンライン(zoom)
   URL:https://future-for-children.rohto.co.jp/microbe/
   NITEの参加形態:講演

第5回  国際発酵・醸造食品産業展
   日時:2026年8月4日(火)~8月6日(木)
   会場:東京ビッグサイト南展示棟(東京都江東区有明3-11-1)
   URL:https://hakkoexpo.jp/
   NITEの参加形態:ブース出展、セミナーでの講演
 
   編集後記
   私事ですが、新年度になって居住地が変わり、新しい環境での生活が始まりました。日常生活では新鮮に感じる場面も多くあります。例えば、休日には運動を兼ねて30分ほど音楽やラジオを聴きながら散歩をするのですが、目に映る景色は見慣れないものが多く、自然と好奇心がわいてきます。最近は少しずつ今の環境にも慣れてきているので、こうした新鮮さも次第に薄れていくと思いますが、感じられるうちは楽しみたいと思います。(NY)
微生物情報の検索は「DBRP(生物資源データプラットフォーム)」
NBRC株の検索、ご依頼は「NBRCオンラインカタログ」
微生物に関するご相談は「微生物コンシェルジュ」
微生物の有害情報の検索は「M-RINDA」
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