ヒト由来微生物
【リストを更新しました】
ヒト由来微生物株リスト、ヒト糞便由来微生物株リストの更新（2023.8.24）
ヒトの腸管、口腔、皮膚等に存在する微生物叢（ヒトマイクロバイオーム）と健康との関連性が次々と明らかになるなか、ヒトマイクロバイオームをシーズとして活用した医薬品や食品等の開発に期待が高まっています。一方で、ヒトマイクロバイオームを構成する微生物は未だ分離されていないものも多く、研究開発に利用できる微生物株が少ないことが産業化に向けた課題となっています。
そこで、NITEでは製品開発にも使用できる権利が明確化された微生物株の整備を行うため、ヒトの様々な部位より微生物を収集し提供しています。
ヒト由来微生物の収集
NITEでは、ヒト由来試料（糞便、口腔、皮膚等）から網羅的に微生物を収集するため、複数の培地・培養条件を使用した培養と、MALDI-TOF MSや16S rRNA遺伝子塩基配列解析などによる迅速同定を組み合わせた方法（Culturomics）を用いて微生物の分離を行っています文献1, 2)。この方法により、重複株の判別にかかる時間を短縮することが可能となり、微生物収集の効率化に成功しています。
ヒト由来微生物の提供
外部の研究者や研究機関から収集した微生物に加え、NITE 自らで分離し、その一部をNBRC株、RD株として提供しています。
下記のリスト以外でご希望の菌株がある場合は、本ページ下のお問い合わせ先にご連絡ください。
| リスト一覧 |
| 最新のリストは、下記アイコンからダウンロードできます。
（2023.8.24 リスト更新）
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ヒトの糞便から分離した微生物について
ヒト腸内での優占種に加え、肥満との関連性や免疫機能の抑制作用等が示唆されている種が含まれます。ヘルスケア分野の新たな研究開発リソースとしてご利用ください。
- ヒト糞便由来微生物株リストダウンロード【Excel：40KB】 （2023.8.24更新）
| ■ 日本人の糞便から分離された微生物株（一例） | ||
| 近縁種※1 | RD番号 | 近縁種で確認されている特性 |
| Acidaminococcus intestini | RD014252 | 酪酸生成菌文献3) |
| Christensenella minuta | RD014214 | 肥満抑制文献4) |
| Flavonifractor plautii | RD014238 | 制御性Ｔ細胞（Treg細胞）の誘導文献5) |
| Intestinimonas butyriciproducens | RD014241 | 酪酸生成菌文献6) |
| Ruminococcus torques | RD014899 | ムチン分解文献7) |
| Parasutterella excrementihominis | RD014545 | 日本人から初めて分離された種文献8) |
- ※1：16S rRNA遺伝子の相同性検索により得られた近縁種名を記載しております。
- 文献3：Acidaminococcus intestini sp. nov., isolated from human clinical samples. Int J Syst Evol Microbiol. 2007 Oct;57(Pt 10):2314-9.
- 文献4：Human genetics shape the gut microbiome. Cell. 2014 Nov 6;159(4):789-99.
- 文献5：Treg induction by a rationally selected mixture of Clostridia strains from the human microbiota. Nature. 2013 Aug 8;500(7461):232-6.
- 文献6：Intestinimonas butyriciproducens gen. nov., sp. nov., a butyrate-producing bacterium from the mouse intestine. Int J Syst Evol Microbiol. 2013 Dec;63(Pt 12):4606-12.
- 文献7：Characterizing the mucin-degrading capacity of the human gut microbiota.Sci Rep. 2022 May 19;12(1):8456.
- 文献8：Parasutterella excrementihominis gen. nov., sp. nov., a member of the family Alcaligenaceae isolated from human faeces. Int J Syst Evol Microbiol. 2009 Jul;59(Pt 7):1793-7.
ヒトの口腔から分離した微生物について
近年、口腔内微生物は口腔だけでなく全身の健康にも関与することが報告されています。ヘルスケア分野の新たな研究開発リソースとしてご利用ください。
- ヒト口腔由来微生物株リストダウンロード【Excel：30KB】 （2023.7.14更新）
| ■ 日本人の口腔から分離された微生物株（一例） | ||
| 近縁種※2 | RD番号 | 分離源（部位） |
| Actinomyces oris | RD014548 | 唾液 |
| Campylobacter showae | RD014547 | 歯垢 |
| Corynebacterium durum | RD014551 | 唾液 |
| Prevotella jejuni | RD014538 | 唾液 |
| Propionibacterium acidifaciens | RD014552 | 歯垢 |
| Veillonella atypica | RD014544 | 唾液 |
- ※2：16S rRNA遺伝子の相同性検索により得られた近縁種名を記載しております。
ヒトの皮膚から分離した微生物について
近年、皮膚に棲息する微生物のバランスが皮膚の健康に大きく影響することが報告されています。スキンヘルスケア分野の新たな研究開発リソースとしてご利用ください。
- ヒト皮膚由来微生物株リストダウンロード【Excel：30KB】 （2023.7.14更新）
| ■ 日本人の皮膚から分離された微生物株（一例） | |||
| 学名 | NBRC番号 | 年代 性別 | 分離源（部位） |
| Brachybacterium paraconglomeratum | 113868 | 40代男性 | かかと |
| Corynebacterium glucuronolyticum | 113808 | 40代男性 | 頬 |
| Corynebacterium gottingense | 113810 | 40代男性 | 掌および指腹 |
| Corynebacterium mucifaciens | 113809 | 30代女性 | おでこ・眉間 |
| Corynebacterium tuberculostearicum | 113812 | 30代女性 | 足指間腔 |
| Corynebacterium ureicelerivorans | 113814 | 40代男性 | 膝 |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes (IA2 type)※3 | 113869 | 30代女性 | 外鼻（鼻周り） |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes (IA2 type)※3 | 113815 | 30代女性 | おでこ・眉間 |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes (IA2 type)※3 | 113816 | 40代男性 | 背中 |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes (IB type)※3 | 113817 | 30代女性 | 頬 |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes (IB type)※3 | 113818 | 40代男性 | あご |
| Cutibacterium acnes subsp. defendens (II type)※3 | 113819 | 40代男性 | 頬 |
| Cutibacterium avidum | 113820 | 30代女性 | 外鼻（鼻周り） |
| Cutibacterium granulosum | 113821 | 30代女性 | あご |
| Micrococcus yunnanensis | 113871 | 40代男性 | 膝 |
| Moraxella osloensis | 113844 | 30代女性 | かかと |
| Pseudopropionibacterium propionicum | 113823 | 40代男性 | 腋窩（えきか） |
| Staphylococcus caprae | 113845 | 40代男性 | かかと |
| Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus | 113848 | 40代男性 | 足指間腔 |
| Tessaracoccus arenae | 113870 | 40代男性 | かかと |
- ※3：Multiplex PCRによる判断（J Clin Microbiol. 2015 Apr;53(4):1149-55.)
ヒトの皮膚のマイクロバイオームを構成する微生物にはニキビの原因菌として有名な「アクネ菌」（Cutibacterium acnes）があります。アクネ菌はサブタイプがIA1、IA2、IB、IC、II、IIIの6つに細分化されており、皮膚の状態との関係について研究が進められています。
NBRCでは、ご紹介したサブタイプのうちIA1、IA2、IB、IIの菌株を保有しています。（下表参照）
詳細についてはメールマガジン第67号 をご参照ください。
| ■ NBRCが保有しているアクネ菌のサブタイプ一覧 | |||
| 学名 | NBRC番号 | サブタイプ | 分離源（部位） |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes | 107605 | IA1 | 顔のニキビ |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes | 113815 | IA2 | おでこ・眉間 |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes | 113816 | IA2 | 背中 |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes | 113869 | IA2 | 外鼻（鼻周り） |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes | 111530 | IB | 顔のニキビ |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes | 113595 | IB | ヒトの皮膚 |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes | 113817 | IB | 頬 |
| Cutibacterium acnes subsp. acnes | 113818 | IB | あご |
| Cutibacterium acnes subsp. defendens | 113819 | II | 頬 |
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生物資源利用促進課
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TEL：0438-20-5763
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